対策本部で指揮を執るのはDMATを統括する結城英晴（小栗旬）と厚労省の立松信貴（松坂桃李）。船内で対応に当たることになったのは結城とは旧知の医師・仙道行義（窪塚洋介）と、愛する家族を残し、船に乗り込むことを決めたDMAT隊員・真田春人（池松壮亮）たち。彼らはこれまでメディアでは一切報じられることのなかった最前線にいた人々であり、治療法不明の未知のウイルス相手に自らの命を危険に晒しながらも乗客全員を下船させるまで誰１人諦めずに戦い続けた。